非标记（Label free）蛋白定量，是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同样品蛋白的数量变化，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。该技术不需要对样品进行任何标记，每个样品可单独上机，样品蛋白直接酶解后经过质谱分析产生数据，通过软件分析后即可确定蛋白质在样品中表达量的变化情况。
利用新一代timsTOF Pro质谱仪，通过捕获双TIMS（Trapped Ion Mobility Spectrometry）-离子淌度谱技术与同步累积连续碎裂（PASEF）扫描模式对样本进行差异定量蛋白质组学研究。在传统3D分离（保留时间、质荷比、离子强度）基础上，增加肽段的碰撞截面积（CCS），实现4D的分离检测。4D- Label free具有更快的速度、更高的灵敏度、更强的稳定性，可以实现检测各种不同基质中的蛋白质，包括单细胞、血清、血浆、脑脊液和尿液等微量样本。
实验流程
样品要求
细胞：5×106个细胞；动物组织：200mg；植物组织：800mg；微生物：400mg；血清血浆：300μl
非标记（Label free）蛋白定量，是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同样品蛋白的数量变化，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。该技术不需要对样品进行任何标记，每个样品可单独上机，样品蛋白直接酶解后经过质谱分析产生数据，通过软件分析后即可确定蛋白质在样品中表达量的变化情况。
