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4D-Label free /Label free 相对定量蛋白质组

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非标记(Label free)蛋白定量,是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同样品蛋白的数量变化,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。该技术不需要对样品进行任何标记,每个样品可单独上机,样品蛋白直接酶解后经过质谱分析产生数据,通过软件分析后即可确定蛋白质在样品中表达量的变化情况。


利用新一代timsTOF  Pro质谱仪,通过捕获双TIMS(Trapped  Ion  Mobility  Spectrometry)-离子淌度谱技术与同步累积连续碎裂(PASEF)扫描模式对样本进行差异定量蛋白质组学研究。在传统3D分离(保留时间、质荷比、离子强度)基础上,增加肽段的碰撞截面积(CCS),实现4D的分离检测。4D-  Label  free具有更快的速度、更高的灵敏度、更强的稳定性,可以实现检测各种不同基质中的蛋白质,包括单细胞、血清、血浆、脑脊液和尿液等微量样本。

 

实验流程

 

样品要求

细胞:5×106个细胞;动物组织:200mg;植物组织:800mg;微生物:400mg;血清血浆:300μl

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非标记(Label free)蛋白定量,是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同样品蛋白的数量变化,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。该技术不需要对样品进行任何标记,每个样品可单独上机,样品蛋白直接酶解后经过质谱分析产生数据,通过软件分析后即可确定蛋白质在样品中表达量的变化情况。
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