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ATAC-SEQ
核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。核小体再折叠最终形成高度压缩的染色质结构。在复制和转录时高度折叠的染色质结构打开并暴露出DNA序列，这段DNA序列可被转录因子和其他调控原件结合，即染色质开放性。同时，这段裸露的DNA区域也是ATAC-SEQ需要研究的部分。
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DNA甲基化芯片
DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一，引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程，包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等，与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。
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全基因组甲基化测序
全基因组甲基化测序首先利用亚硫酸氢盐转化将DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶（甲基化的胞嘧啶保持不变），再结合illumina高通量测序技术对全基因组进行测序，通过比对参考基因组序列可在全基因组进行单碱基分辨率的DNA甲基化图谱分析。
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ChIP-SEQ
染色质免疫共沉淀测序（ChIP-SEQ）是指通过染色质免疫共沉淀特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，然后对其进行纯化与文库构建，illumina高通量测序。通过数据与参考基因组比对，peak分析，可在全基因组范围内寻找目标蛋白特异性结合的DNA序列区段，可用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。
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