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CosMx 单细胞空间组学技术-揭示阿尔茨海默病小鼠模型中小胶质细胞与星形胶质细胞互作机制
阿尔茨海默病(AD)是一种进行性神经退行性变,淀粉样蛋白-β(Aβ)沉积是该疾病的一个关键的神经病理学标志,小胶质细胞和星形胶质细胞的变化与疾病进展密切相关。
넶0 2024-07-12 -
文章解读 | 九院贾仁兵团队揭示CAF促肿瘤血管新生的RNA表观调控机制
通过单细胞转录组及多组学数据分析,揭示了结膜黑色素瘤中肿瘤相关成纤维细胞中m6A去甲基化酶FTO有效擦除VEGFA和EGR1等血管生成相关基因的甲基化,抑制了YTHDF2依赖性的mRNA降解途径,介导血管新生,进而促进肿瘤的发生发展。靶向 FTO 可能作为一种潜在的抗血管生成策略促进癌症治疗。
넶0 2024-07-11 -
相关性分析能从多组学数据中找到多少生物学新发现?
分子组学检测技术和分析方法拓展了生物学研究的深度。然而,怎么样有效利用获得的组学数据,挖掘其中重要的生物学意义,是值得好好去探讨的。
넶0 2024-07-10 -
文章解读 | 仁济医院沈南团队研究成果登顶Science,单细胞转录组与表观遗传的碰撞
近日,上海交通大学医学院附属仁济医院风湿科沈南教授团队和Carola G. Vinuesa共同通讯在Science上发表题为“The transcriptional factor ZEB2 drives the formation of age-associated B cells”的研究论文。该研究揭示了转录因子ZEB2通过JAK-STAT通路调节年龄相关性 B 细胞 (ABC)的特化,驱动自身免疫疾病的发生,为靶向ABC细胞治疗自身免疫性疾病中提供了新思路。
넶0 2024-07-09 -
器官芯片:3D细胞规模化培养的创新引擎,推动医学研究新高度
器官芯片技术(organ-on-a-chip)是将3D细胞培养和微流控技术结合后形成的一种新型体外细胞培养方案,能够在体外更好地模拟不同器官/组织的病理或生理微环境。
넶0 2024-07-04 -
深度神经网络对肿瘤细胞鉴定及空间恶性区域的识别
在肿瘤相关单细胞转录组测序中,肿瘤细胞的甄别一直是一个让人头疼的问题。CNV可以用于区分肿瘤细胞和正常细胞,常用的inferCNV方法往往需要一个清晰的非肿瘤细胞注释做为参考去佐证肿瘤细胞,CopyKAT对于细胞数量多的分析项目是极不友好的,时间成本消耗也是极高的。
넶0 2024-07-03
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