Illumine 850K甲基化芯片介绍：
Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片（即850K芯片）是在450K芯片的基础上，升级推出的新一版本的DNA甲基化芯片，这是一款更强大的甲基化图谱分析工具。
850K芯片仍然保留了450k芯片中91%的位点，又增加了413,745个位点，总位点数为853,307个CpG位点。850K芯片在保留原有绝大多数CpG岛，基因启动子区位点的基础上，主要增加了333,265个来自ENCODE及FANTOM5计划的增强子区探针以及部分基因编码区的探针。兼具全面的覆盖范围和高通量功能，850K芯片是EWAS研究的理想之选。
在探针设计上仍然使用Infinium I和Infinium II双探针设计，Infinium I设计有两种不同的探针，利用单碱基延伸原理U型磁珠尾部为A，用于检测非甲基化位点；M型磁珠尾部为G，用于检测甲基化位点。两个探针的信号值用来区分甲基化的CpG位点和非甲基化的CpG位点的比例； Infinium II每个检测位点只设计一个探针，通过比较该探针掺入的两种荧光的信号值可以计算位点的甲基化比例。
Infinium I和Infinium II探针设计示意图
Illumine 850K甲基化芯片特点：
· 全基因组覆盖(853,307个CpG位点)
· 非CpG岛位点覆盖：
- 人类干细胞中非CpG甲基化位点（CHH位点）
- 肿瘤中差异甲基化位点
- FANTOM5增强子
- ENCODE开放染色质和增强子
- DNase超敏感位点
- miRNA启动子区域
· FFPE样本适用
· 实验方法成熟，数据重复性好（98%技术性重复）
· 样本起始量低，只需250ng
实验流程：
样本要求：DNA≥0.5μg，浓度≥50ng/μl；物种：人
