单细胞测序-上海生物芯片有限公司

GeoMx® Digital Spatial Profiler全面的空间生物学解决方案

2020 年，Nature Methods 将空间转录组学评为“年度方法”标志着空间组学的到来，其可为研究者留下空间位置信息，这激发了研究者对于空间生物学领域的探索。 GeoMx® Digital Spatial Profiler (DSP) 为全面的空间生物学解决方案，其通过一张切片可同时实现空间转录组学和空间蛋白质组学的研究；其可通过区域圈选的方式实现指定位置的探索，堪称生物界的GPS！您可以通过功能分割在空间上解析组织和细胞群；以较高的plex和灵敏度检测更多的转录组和蛋白质组；使用标准组织学工作流程从FFPE、FF组织和TMA中获得经过验证的可靠结果。通过这项技术，您亦可知道细胞的空间结构，以及它与周围环境的相互作用。

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单细胞测序和空间转录组高级分析

细胞间的信息交流（cell-cell communication）是通过配体与其受体相结合，引起特定细胞信号通路信号激活以及产生各种复杂的反应为基础。研究这些配体-受体相互作用对理解不同细胞类型间的细胞通讯网络及其参与的复杂生物学过程具有十分重要的意义。基于配体-受体的细胞互作分析是单细胞测序的高级分析之一。常用的细胞通讯分析软件：CellPhoneDB、CellChat。

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10x Visium CytAssist 空间转录组测序

从新鲜样本到FFPE样本，空间转录组测序已经把可用有意义的临床样本最大程度地利用到疾病的研究中。然而，在实际的实验过程中，新鲜包埋样本或者FFPE样本的一些本身问题和技术平台的限制，导致我们理想中的空间转录组测序并不是一帆风顺。
之前的Visium新鲜样本实验需要对术后的样本进行及时冰冻包埋，且组织截面积大小不能超过6.5*6.5mm的芯片规格，对冰冻样本的RNA质检结果需要达到RIN值7以上。同时，该实验需要一次性同时做4个矩阵，即需满足4个样本切片，样本质检的透化预实验时间还需比较接近。

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单细胞测序

单细胞测序技术在2013年被 Nature Methods 评为年度技术，被Science评为年度六大生物类科研热点的首位，又在2015年登上Science转化医学封面。 Nature Methods 将2019年年度技术又给了单细胞多组学。2013年以来基于单细胞测序技术获得了多方面的研究进展，文献发表也呈现迅猛增长趋势。即使来源相同的单个细胞，由于随机生物过程和环境扰动的原因，彼此在许多方面也存在差异，即异质性。尤其是肿瘤细胞、免疫细胞、胚胎发育期细胞、干细胞等最为突出。常规的组学技术发现不了这一现象带来的影响，由此研究人员开启了单细胞测序技术的探索之路。

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