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单细胞测序和空间转录组高级分析
使用与空间转录组来源相同或者相近的单细胞转录组数据,对空间中每个Spot中的细胞类型进行推测,最后会推测出空间转录组中的每个Spot对应单细胞细胞类型。
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Visium空间转录组测序
单细胞检测技术的发展为理解组织中细胞的组成与功能提供了手段。但是,现有的方法虽能检测到细胞类型,却无法真实还原在组织中的空间组成位置。空间转录组学技术的发展通过将传统组织学技术的优势与高通量RNA测序技术融合,为检测组织中的细胞空间组成与基因表达提供了一个强有力的检测手段。2021年Nature Methods将空间转录组列为2020年度技术。
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单细胞测序
单细胞测序技术被Nature Methods(2013)评为年度技术,Science(2013)评为年度六大生物类科研热点的首位。单细胞测序技术又在 2015年登上Science转化医学封面。Nature Methods 将2019年年度技术又给了单细胞多组学。2013年以来基于单细胞测序技术获得了多方面的研究进展,文献发表也呈现迅猛增长趋势。即使来源相同的单个细胞,由于随机生物过程和环境扰动的原因,彼此在许多方面也存在差异,即异质性。尤其是肿瘤细胞、免疫细胞、胚胎发育期细胞、干细胞等最为突出。常规的组学技术发现不了这一现象带来的影响,由此研究人员开启了单细胞测序技术的探索之路。
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