生信实用小工具——不一样的热图
在展示多样本数据分布时,除了箱型图和小提琴图,密度热图也是一个不错的选择。下面我们就来了解一下ComplexHeatmap包绘制出的密度热图。
官方介绍网站:
https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/

01 密度热图介绍
密度热图中每列为一个样本,颜色体现密度,越接近深红色密度越高,深蓝色为密度低。五条黑色虚线分别对应了五个分位,红色虚线为均值。
02 参数调整
1、修改y轴范围

2、修改色阶

3、样本聚类

4、添加列注释
下图在上方添加了颜色条,用于区分样本分组,下方添加了散点图注释。

03 添加为热图列注释
密度热图不仅可以添加列注释,也可以作为列注释添加在常规热图的上方或下方。下图添加了两个列注释,第一个是密度热图,用于展示样本表达值的分布情况;第二个是柱状图,用于展示每个样本中某指标的高低。

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