234 篇文章
  • CosMx SMI:获得“单细胞”的空间转录组信息

    3 24-04-18
  • 您的图片您做主——线图绘制

    线图通常用于展示数据的变化趋势,常见的有折线图、垂线图等。在SBC ToolBox,您可以轻松绘制多种线图,并对图片进行各种自定义调整。

    2 24-04-15
  • 单细胞空间多组学思路推荐:在阿尔兹海默症脑组织中鉴定新的小胶质细胞群体

    阿尔兹海默症(AD)是一种神经退行性疾病,会导致认知能力下降。神经炎症是AD的病理特征之一,主要由小胶质细胞驱动。为了研究年龄和APOE基因型对小胶质细胞的影响,本文利用单细胞转录组、可及性检测和多重原位转录组检测技术,整合单细胞与空间组学数据,绘制了AD小胶质细胞图谱,鉴定出一种新的耗竭样小胶质细胞群体,解析其功能以及与AD进展的关系。

    2 24-04-09
  • 百篇文献汇总精华!单细胞高级分析(六)-信号通路富集分析

    单细胞数据结果提供了不同细胞类型之间的差异表达基因,这些基因参与的生物学通路决定了不同细胞类型的生物功能。因此,针对不同细胞类型的特有基因进行富集分析,可以更好的了解每种细胞类型参与的独特生物学功能,揭示和理解生物学过程中的关键分子机制。富集分析工具有GO、KEGG、GSEA和GSVA等,其中GSEA和GSVA是单细胞文章中常见的富集分析工具。

    5 24-04-08
  • 百篇文献汇总精华!单细胞高级分析(五)-拷贝数变异分析

    在基因组变异中,拷贝数变异(CNV) 是癌症的重要遗传驱动因素 。CNV 是基因组事件,其中特定基因的拷贝数因个体而异,甚至因细胞而异。肿瘤细胞与导致基因扩增和基因缺失的体细胞CNV变化有关。然而,由于缺乏单细胞全基因组测序,很难在单细胞中检测和量化CNV事件。

    4 24-04-02