由于缺乏在没有疾病和死后快速降解的情况下从胰腺获取组织的迹象,因此对成人健康胰腺的研究很少。研究者从脑死亡捐献者那里获得胰腺,从而避免了任何热缺血时间。这 30 名捐赠者年龄和种族各不相同,并且没有已知的胰腺疾病。对样本的组织病理学分析显示,无论年龄如何,大多数个体都存在胰腺上皮内瘤变(PanIN)病变。
空间组学研究提供了在组织结构的空间基因信息,通过结合单细胞数据,能够描述细胞类型在肿瘤组织中空间分布的差异、细胞间的相互作用以及免疫细胞的不同分布对预后效果的影响等,为肿瘤的治疗及预后提供新的思路。GeoMx® DSP 空间转录组技术和空间蛋白技术能够同时提供转录组和蛋白组的表达谱,广泛应用于肿瘤异质性、肿瘤的发生与发展、肿瘤免疫微环境等研究方向。
今天小编带来一篇发表在Nature上的胶质瘤相关的文章解读。该文章利用单细胞转录组技术找到了一群独特的肿瘤细胞亚群,并利用GeoMx DSP空间转录组检测技术确认了这群特殊肿瘤细胞在大脑组织中的空间位置分布。在这篇文章中,我们可以看到研究者是如何发挥单细胞和空间转录组技术的优势,并将两种不同技术的结果巧妙地串联在一起,从而解析神经元活动促进胶质瘤进展的分子机制。
腰椎间盘退变性疾病(IDD),引起严重慢性腰腿痛,给患者及社会带来极大负担。目前多采用保守治疗缓解症状,但复发率高。当保守治疗无效后,腰椎融合手术成为唯一有效的治疗方法。但是该手术需要牺牲正常腰椎活动度,存在邻近节段椎间盘退变加速,手术风险大、花费大等问题。
空间转录组云平台是SBCToolBox的一个VIP模块,包括了数据的输入、预览、类群的展示、差异计算、降维可视化、基因在空间位置表达的可视化、常见的小提琴图、山脊图、热图、DotPlot展示、亚群分析,meta信息添加等组件。