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“芯空一号” Update:【空间原位】【单细胞】【全转录组】 CosMX WTx开启空间多组学技术新纪元—正式开放预订

 

基于成像的空间原位单细胞技术由于然受到光谱重叠、荧光团可用性以及光学拥挤环境中信噪比的影响,RNA检测往往面临着显著的靶标数限制。CosMx WTx (CosMxTM Human Whole Transcriptome Panel;~19000-plex RNA)技术突破通量限制,实现超高分辨率+空间原位+全转录组检测,以超多重检测能力、亚细胞级空间定位和单分子灵敏度,重新定义RNA分析的极限,为生命科学研究带来革命性突破!

 

CosMx WTx已在包括极具挑战性FFPE在内的多种样本类型中得到验证,目前已正式开放预订。

 

img1

 

● 独特的探针设计和化学结构,在FFPE样本中实现更高的细胞和转录本检出率

CosMx WTx检测试剂盒探针原位杂交探针设计基本包含了全部人类蛋白编码基因( 占HUGO所注释的蛋白编码基因的99.5%以上)。捕获序列的选择遵循了严谨的迭代设计过程,保证了探针针对靶标的特异性,同时在RNA分子高度片段化的FFPE组织中也能实现高检测灵敏度。

 

● 稳定高效的原位杂交循环成像化学原理

(1)可实现高信噪比(SNR)检测,精准识别单个荧光信号点;

(2)通过紫外线(UV)可以快速、温和地淬灭荧光信号;

(3) 在工业生产过程中严格控制,确保每个检测转录本的原位成像具有相同的光斑大小和荧光强度。

 

● 高分辨率的大数据输出

CosMx WTx利用先进的光学系统和低体积微流体技术,能够高效地实现对数百万个细胞进行分析,获得全面的空间信息。

 

● 自适应解码算法提高数据质量

CosMx WTx采用了最先进的自适应解码算法,通过动态调整最大限度地捕获转录本和最小化非特异性信号,为转录本计数提供了更高的可信度,实现更精确的单细胞分析。

 

● 广泛适用于多种组织类型

已证明可广泛适用于各种组织类型,例如不同类型肿瘤组织、脑组织、皮肤等,同时兼容蜡块、FFPE组织切片、新鲜冷冻样本等多种样本类型送样。

 

● 高动态范围和全面的转录本检测

以下是官方验证CosMx WTX在FFPE样本中的检测能力和性能表现:对六种不同的人类组织类型(结肠、胰腺、海马、皮肤、乳腺、肾脏)的5μm FFPE切片进行检测,每个样本(约1cm2检测面积)能够获得30万~60万个具有空间背景的单细胞,六种组织类型检测基因数在8,392-15,960之间,每个细胞检测到约1,556个转录本(中位数)。

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官方数据展示

 

● 精准的细胞分割算法

CosMx SMI的细胞分割方法结合了细胞核、细胞体、细胞膜等多种高分辨率细胞形态成像信息和数据驱动的机器学习算法,从而获得精准的单细胞边界界定。

img3

官方数据展示

 

 

CosMx WTx空间单细胞全转录检测技术是空间转录组学领域的一个重要里程碑,其建立在循环原位杂交化学的基础上,通过原位成像实现了超高分辨率覆盖全转录组检测,解决了基于成像的单细胞空间转录组技术通量上的局限,支持研究人员全面地了解完整组织环境中的细胞及分子机制,从而为生物发现和治疗干预提供新的见解。

尖端生命科学与生物医药创新技术服务中心(CITC)-SBC服务平台部深耕组学研究20年,无论是芯片还是测序,单细胞亦或是空间组学,经验丰富的我们与“芯空一号”,让您的生命科学研究更上一层楼。欢迎各位老师前来咨询!

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