转录组和蛋白组联合分析没思路？3种方法让你快速上手！

转录组测序和蛋白组检测是组学分析中最常见的两种高通量检测方法。在分别得到了转录组和蛋白组的分析结果，找到了差异基因/蛋白后，如何做两个组学的联合分析呢？本文来介绍几种较为常见的联合分析方法。

01四象限图

用散点图展示基因在两个组学中差异倍数取对数后的结果，体现差异倍数的关联性。下图中横轴为基因在转录组中的Log2FC，纵轴为蛋白组的Log2FC，右上角区域的红色点代表在两个组学中皆为上调的差异基因，左下角的深蓝色点代表在两个组学中皆为下调的差异基因，这两个区域点的数量越多，两个组学结果的关联性越强。

02 相关性热图

用两个组学共有差异基因的表达量绘制相关性热图，下图中的主对角线为相同基因在转录组与蛋白组中表达量的相关性，可以看到颜色都是比较深的红色，表示相关性较高。

03 富集分析热图

筛选出两个组学的差异基因共同富集到的通路，用富集分析得到的Pvalue取-log10对数绘制热图，展示在两个组学中显著富集的通路。

以上就是转录组与蛋白组的一些常见联合分析方法，直观明了地展示了基因或者功能在两种不同组学中的关联和差异，更多分析方法等你来探索！