Nature文章 | 空间转录组技术助力揭示驱动病毒性肺炎后遗症“肺纤维化”的关键机制

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文章题目：An aberrant immune–epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae

发表时间：2024.10

期刊名称：Nature

影响因子：50.5

实验平台：10x Visium 空间转录组测序；免疫荧光；RNAscope

DOI：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07926-8

研究内容

1、研究背景

尽管疫苗接种和抗病毒药物的应用显著降低了COVID-19急性感染的致死率，但大量康复患者仍存在SARS-CoV-2后遗症（PASC）。在急性感染后的恢复阶段，部分患者会出现持续的炎症反应和器官功能障碍，尤其是在肺部，表现为呼吸困难、肺功能下降、影像学异常以及最终可能发展为肺纤维化（PASC-PF） 。免疫系统和受损的器官之间的复杂的相互作用可能驱动了疾病的长期进展，但目前有关其对PASC的形成以及长期维持机制仍未有明确研究。

2、研究内容简介

本研究通过对PASC患者肺组织（n=3）样本进行10x Visium空间转录组学及其它高分辨率成像技术检测，系统性地研究在PASC中CD8+ T细胞和巨噬细胞之间的相互作用在驱动肺纤维化中的机制。结果发现，在急性感染后期CD8+ T细胞持续存在于肺组织中，并通过释放高水平的 IFN-γ 和 TNF，激活局部巨噬细胞并随后持续释放IL-1β，从而诱导炎症级联反应并在局部形成了一个异常的免疫-上皮祖细胞生态位，阻碍正常的肺泡再生过程，并最终导致纤维化的发生。

Fig1.10x Visium|空间转录组学揭示 PASC-PF 肺持续性损伤机制

主要结论

本研究通过联合多种空间技术，揭示了在病毒性肺炎后遗症中，免疫系统与上皮祖细胞之间的异常互作是驱动肺纤维化的关键机制，不仅为理解PASC的病理机制提供了新的视角，还为开发有效的治疗策略提供了坚实的基础。

参考文献：

Narasimhan H, Cheon IS, Qian W, et al. An aberrant immune-epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae. Nature. 2024;634(8035):961-969. doi:10.1038/s41586-024-07926-8