柱形图在单细胞转录组分析中也能玩出花来——看我七十二变
在我们对单细胞数据进行一系列分析之后,有什么好的方式来展示这些分析结果呢?柱状图可能是您可选的一种方式。柱形图,一种能展示出很多种花样来可视化展示方式。
比如,我们在对单细胞数据进行分析后,想要去展示下不同样本中细胞的比例,我们可以用如下展示方式:

除了常见的柱状图形式外,我们还可以用堆叠的方式展示每个样品中不同细胞类型的占比:

而当我们做了差异分析,也可以用柱状图展示不同细胞类型之间的差异表达基因数量。

此外,当我们做了富集分析,拿着GO/KEGG富集结果不知所措时,柱状图也能很好地表达出不同情况下的富集差别。
同一种细胞类型的上调基因和下调基因分别富集在不同的GO TERM中:

同一种细胞类型的高表达基因在不同ONTOLOGY下的富集情况:

多个cluster的高表达基因在不同GO TERM中的富集情况:

多个cluster的高表达基因在不同KEGG通路中的富集情况:

简简单单的柱形图,如果我们想要展示的目的清楚了,对其稍加变换,就可以衍生出不一样的展现效果。有了以上的抛砖引玉,您想到柱形图在单细胞数据中的其他应用了吗?
新闻中心
News Senter
上海生物芯片有限公司
Shanghai Biochip Co., Ltd.
版权所有©上海生物芯片有限公司
电子邮箱:
marketing@shbiochip.com
地址: 上海市浦东新区张江高科技园区李冰路151号
技术电话:
4001002131
扫描查看
微信公众号