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好不容易把蛋白挑选出来,老板问我这个蛋白的亚细胞定位-CELLO网站使用指南

 

亚细胞定位是指将生物大分子定位到细胞中的某个具体位置,有助于发现其作用。在CELLO(subCELlular LOcalization predictor)在线网站,只需提交DNA或蛋白序列即可获得亚细胞定位的预测结果。

 

CELLO网址:http://cello.life.nctu.edu.tw/

 

img1

 

只需将DNA或蛋白序列复制到输入框中,设置上方两个参数,提交分析,很快就能得到预测结果。CELLO通过SVM算法,结合多个分类器的打分进行预测,结果如下图所示。

 

img2

 

在第三段文字“CELLO Prediction”中可以看到该蛋白在每一个位置的打分,分数后带*的即为可能性最大的位置。除此以外,点击页面上方的“CELLO RESULTS”还可以看到表格形式的结果,文件为txt格式。

 

img3

 

我们可以将感兴趣的蛋白批量提交分析,整理预测结果,计算出不同定位的蛋白数量或占比,绘制柱状图或饼图进行展示。

 

img4

 

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