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新闻中心   News Senter

您的图片您做主——线图绘制

 

线图通常用于展示数据的变化趋势,常见的有折线图、垂线图等。在SBC ToolBox,您可以轻松绘制多种线图,并对图片进行各种自定义调整。

链接:https://www4.shbiochip.com/V2023/SBCToolBox/

 

img1

 

 

01 棒棒糖图

 

由点和垂线组成,形似棒棒糖。可用于展示各样本的基因表达值高低。

链接:https://www4.shbiochip.com/V2023/line/lollipop/

 

1.1 输入文件

画图需上传数据文件和分组文件(非必需)。画图数据文件为各样本某个基因的表达值,分组文件为样本的分组信息。两个文件都要有表头。

 

img2

画图数据

 

img3

分组数据

 

准备好输入文件后,将文件拖动到对应框中,上传完毕后点击“提交分析”,即可生成图片。

 

img4

 

1.2 结果展示

图中横轴为样本,纵轴为基因表达值。上传分组数据后,垂线颜色体现样本分组。

img5

 

1.3 参数调整

您可以在参数调整设置中对图片进行各种个性化调整,例如修改垂线颜色、点颜色、垂线宽度、字体大小等。

img6

 

 

02 哑铃图

 

由线和两点组成类似哑铃的形状。用于展示基因在两个分组中的表达情况。

链接:https://www4.shbiochip.com/V2023/line/dumbbell/

 

2.1 输入文件

文件内容为基因在两组中的表达值。

img7

 

2.2 结果展示

图中横轴为基因表达值,纵轴为基因,点的颜色体现组别。

img8

 

 

03 平行坐标图

 

用时间序列数据画图,展示各cluster基因表达值在不同时间点的变化趋势,用于找出表达模式相似的基因。

链接:https://www4.shbiochip.com/V2023/line/parcoord/

 

3.1 输入文件

画图数据文件为基因在各时间点的表达值,分组文件为基因对应的cluster。下图展示文件前6行数据。

img9

画图数据

 

img10

分组数据

 

3.2 生成结果

图中每张小图为一个cluster所有基因表达值的折线图,白色点为各时间点基因表达值均值。

img11

 

 

04 层级聚类图

 

通过基因表达值对样本进行聚类分析,可反应出样本之间的相似性情况。

链接:https://www4.shbiochip.com/V2023/line/dend/

 

4.1 输入文件

画图数据为基因在不同样本中的表达值,分组文件为样本对应分组。

 

img12

数据文件

 

img13

分组文件

 

4.2 生成结果

图中线条颜色对应cluster,样本标签颜色对应样本分组。

img14

 

4.3 参数调整

在参数调整界面可以选择是否对数据进行Log2转换、聚类方法、cluster个数、展示类型。

 

img15

将展示方式改为“Circle”,生成环状聚类图。

 

img16

 

 

05 误差线+折线图

 

在折线图上添加误差线,用于展示基因在不同样本分组中的表达趋势。

 

5.1 输入文件

画图数据保存各样本在不同时间点的某个基因的表达值,表格中行为时间点,列为样本。分组数据与层级聚类图的分组数据格式一致。

 

img17

数据文件

 

5.2 生成结果

图中的点为各组样本在各时间点的表达值均值,误差棒体现表达值的误差范围。

 

img18

 

 

06 误差点线+折线图

 

与上图类似,在折线图各点的位置画误差点线图。

img19

 

 

07 误差CrossBar图

 

在折线图各点的位置画箱型图。

img20

 

以上图片均使用SBC ToolBox绘制。SBC ToolBox在线绘图工具拥有条形图、线图、点图、热图、富集分析等多类图片绘制功能,注册后即可免费绘制各种自定义图片,快来看看吧。

 

链接:https://www4.shbiochip.com/V2023/SBCToolBox/

 

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