单细胞空间多组学：科研界的新宠，单细胞测序的强补充

在生物医学研究的前沿，单细胞测序技术已经为我们打开了一扇窗，让我们得以窥见细胞的微观世界。然而，随着科技的飞速发展，单细胞空间多组学技术正悄然崛起，它不仅能够揭示单个细胞的基因表达，还能告诉我们这些细胞在组织中的具体位置。

那么，这是否意味着单细胞空间多组学将逐步替代传统的单细胞测序技术呢？

曾经的革命与升起的新星，

替代还是互补？

单细胞空间多组学是否会替代单细胞测序呢？目前看来，这两种技术各有优势，它们更可能是互补而非替代关系。单细胞测序在某些研究场景下仍然是不可或缺的，尤其是在需要高通量基因表达分析的情况下。而单细胞空间多组学则在需要空间信息的场合展现出其独特的价值。目前来看，想要进行更深入的研究，获得可靠成果，同时选用两个甚至多个组学平台，使研究内容能够相互佐证、相互补充十分必要。

单细胞空间原位产品——CosMx™ Human 6K Discovery Panel

作为单细胞空间原位技术的代表性平台，CosMx™ Human 6K Discovery Panel共包含人6180个蛋白质编码的RNA基因，几乎覆盖了整个Reactome数据库，接近已知的全部生物学通路。

在NanoString所公布的6K panel具体检测结果中我们可以看到，研究人员检测了八种不同组织类型的FFPE切片，包括人类的脑、皮肤、肺、乳腺、肝脏、结肠、胰腺和肾脏。对于每一张组织切片还同时检测了四种蛋白质形态学marker和DAPI，以识别组织形态并提高细胞分割的准确性。此外，研究团队还开发了三级分析算法，用于细胞分型、配体-受体分析、基因和配体共定位分析、细胞间相互作用和通路分析。

利用CPA样本分析CosMx 1K和CosMx 6K中共有靶标的检测结果表明，这两种检测方案具有很强的一致性。

对于CosMx™ SMI 1000 gene panel，SBC也发布了实测数据结果。

从测试数据来看，在样本选取的40个FOV中，检测到的细胞数达到17万多，检测到的总转录本数超过35M，平均单个细胞的转录本约210条，单个细胞最高基因检出数为564，灵敏度高且特异性表现较好。

（更多详情点击：实测数据结果展示 | SBC顺利完成首批CosMx™ SMI空间原位分析实验！）

未来展望

随着技术的不断进步，我们可以预见，单细胞空间多组学将在未来的研究中扮演越来越重要的角色。它将帮助我们更深入地理解生物系统的复杂性，推动个性化医疗和精准治疗的发展。同时，我们也期待单细胞测序技术能够与空间多组学技术相结合，为我们提供更加全面和深入的生物学见解，并且能够在分辨率、靶标数和敏感性等方面不断提升。

结语

在科研的道路上，每一次技术的革新都是对未知世界的一次探索。单细胞空间多组学技术的兴起，不仅为我们提供了新的研究工具，也为我们打开了新的科学视野。让我们拭目以待，看这两种技术如何共同推动生命科学的新篇章。