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新闻中心   News Senter

您的图片您做主——进阶分布图绘制

 

在之前的文章中,我们介绍了几个SBC ToolBox绘图平台的分布图绘制工具(链接:您的图片您做主--数据分布图合集),这次我们来继续了解更多种类的数据分布图。

 

 

图片

 

链接:https://www4.shbiochip.com/SBCToolBox/进入后选择“分布图”。

 

 

配对箱线图(上左图)

 

用箱线图绘制配对数据,箱线图展示数据分布情况,线连接配对数据。

 

1.1 输入文件

 

画图需要上传画图数据,数据第一列为基因信息,剩余列为基因在不同样本中的表达值。

 

图片

 

如果样本有分组,可上传分组信息。表格第一列为样本名,与画图数据的表头对应,第二列为样本分组。若未上传分组文件,样本会默认被分成两组。

 

图片

 

1.2 参数调整

 

图片

 

1.3 结果展示图中横轴为样本,纵轴为基因表达值取log2结果。箱子的上下边分别代表数据的上下四分位数所在位置,中间的线为中位数位置。配对样本间,代表同一基因的两个点通过线连接。上传分组数据后,箱子根据分组填充颜色。

 

图片

 

 

蜂群图

 

通过水平方向上点的数量来展示数据的分布情况,类似于蜜蜂在蜂巢中的排列。蜂群图的输入文件格式与配对箱线图一致。

 

图片


 

矩阵散点图

 

计算基因间或者变量间的相关性,并绘制数据分布图。

 

3.1 输入文件

 

文件第一列为样本名,第二列为分组,剩余列为基因表达值。

 

图片

 

3.2 生成结果

 

图中不同颜色代表了不同分组,对角线区域为基因的表达密度曲线。对角线以下的三角区域为散点图,展示不同基因间表达的散布情况。对角线以上区域展示基因间的相关性系数。

 

图片

 

 

直方图

 

横轴为基因表达值区间,纵轴为区间内的基因数,用颜色区分样本。

 

图片

 

 

Tufte箱线图

 

隐藏箱子轮廓,由点和线组成箱线图,相比传统箱线图更为简洁。

 

图片

 

以上分布图均使用SBC ToolBox绘制, SBC ToolBox共有七十余种在线绘图工具,包含条形图、线图、点图、热图、富集分析等多类图片绘制功能,目前还在持续更新中,注册后即可免费绘制各种自定义图片,快来看看吧。

 

图片

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