空间转录组实验：如何准确描述OCT切片方向？
空间转录组的主要魅力就在于能够获取转录组的空间位置信息，在进行空间转录组测序实验时，首先需要获取感兴趣的组织切片。而对于OCT包埋的组织来说，从不同方向进行切片所得到的结果是不同的。因此，在开展实验时如何有效地与实验操作人员沟通，对切片方向进行准确描述，从而顺利获得感兴趣的组织切片十分重要！
完成组织包埋后，第一件事就是标记包埋盒并拍照记录样本情况。包埋盒默认方向如图所示，E为包埋盒底面，F为包埋盒上方，逆时针依次标记为A、B、C、D。
可对组织进行三种维度的切片，分别是：水平面，冠状面和矢状面。文字描述有些抽象，我们不妨看图。
01
水平面：从E往F切（或从F往E切）
02
矢状面：从B往D切（或从D往B切）
03
冠状面：从A往C切（或从C往A切）
若无特别说明，SBC空间小分队的伙伴们会默认从包埋盒底面开始切，就是从E往F面切。如果你所感兴趣的组织切片并不是前面我们所描述的水平面，就需要在切片前与实验操作人员充分沟通，准确描述你所期望的切片方向。
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