合作战“疫”：空间转录组测序开放课题招募，约吗？

空间转录组测序以冰冻切片为材料，解决了细胞解离和细胞活性要求的限制，也将样本取下后到建库、测序留有足够的时间。通过将冰冻切片进行组织染色和芯片的细胞捕获，实现同时对空间位置的保留和“单细胞”标记及基因表达检测。

图1 芯片组成与探针特点

后期通过将组织染色结果与基因表达矩阵的结合，实现细胞、基因表达、空间位置的3D建模，为正确识别组织中不同细胞的类型和基因表达特征提供可能。

图2 数据展示

通过空间转录组测序，结合后续的数据分析方案，可实现多种分析需求：组织区域中的基因表达展示，单个特定区域的基因表达模式分析，不同区域中基因表达模式比较和基于机器学习的细胞类型鉴定。

图3 空间转录组分析内容

空间转录组测序解决方案可检测完整组织切片中的总mRNA，并绘制发生基因活性的区域图谱。该解决方案提供了基因表达变异定位的高分辨率视图，可应用于癌症，神经科学，发育生物学等多种领域。该技术在识别不同的细胞类型的同时，保留其空间位置信息，可以提供细胞功能，表型和组织微环境中位置关系等重要信息。