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WTX领航多组学融合:SMI单细胞空间全转录组-SMI空间蛋白共检

 

在空间生物学的时代浪潮中,CosMx™ Spatial Molecular Imager(SMI) 一直以单细胞级别的空间分辨率和全转录组级别的检测深度领跑行业。如今,SMI Whole Transcriptome(WTX)再度升级,不仅实现了18000+基因的全覆盖转录组检测,更可与空间蛋白检测同步开展,在同一张组织切片上实现 RNA与蛋白信号的真实共现,让生命过程的分子语言与功能行为在同一视野中被精准捕捉。

 

img1

 

 

技术突破:单片实现RNA与蛋白共检

传统空间组学研究常面临一个核心痛点:RNA与蛋白的检测需依赖不同切片,跨片配准误差难以避免。而在SMI平台上,这一问题被彻底解决。

WTX平台以18000+基因的全转录组覆盖能力,为空间生物学提供了前所未有的表达深度。而在此基础上,SMI Protein Panel进一步扩展检测维度,覆盖64种核心功能蛋白,不仅包括细胞膜与胞内信号蛋白,还可检测细胞外分泌蛋白与基质组分。

● 免疫检查点分子:PD-1、PD-L1、CTLA4

● T细胞活化与疲劳标志:CD25、CD69、TIM3

● 信号转导分子:pSTAT1、pAKT

● 细胞外基质与分泌蛋白:Collagen IV、Fibronectin、MMP9等

这套组合实现了转录组层面的系统性与蛋白层面的功能性完美融合,使研究者能够在一个实验中,获得同一空间坐标下的双维度数据。

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通过将转录组学谱与同一细胞中的蛋白质表达相结合,更准确地识别细胞类型和状态

 

 

方案价值:从转录景观到功能真相

相比传统分层检测模式,WTX+蛋白共检方案的价值在于四点核心提升:

1.真共检,而非后配准:RNA与蛋白信号来自同一切片,避免跨片配准误差,使细胞状态识别与通路分析更精准可信。

2.功能维度更具解释力:WTX提供转录层的全面表达背景,而蛋白数据则反映信号活性与功能执行,实现表达-调控-功能的一体化解析。

3.定量关联自然:同一细胞内RNA丰度与蛋白表达量的联动可直接计算,适合开展通路活性评分、免疫功能分层、药物应答预测等高价值分析。

4.功能与环境双维解析:不仅揭示细胞内通路活性,还可追踪细胞外分泌因子与基质分布,实现对细胞-细胞通讯与组织微环境动态重塑的多维解读。

img3

通过分析完整组织内的RNA和蛋白质,绘制细胞异质性和细胞间相互作用,该图像显示了组织的细胞外成分(黄色的纤维连接蛋白)

 

 

应用场景:精准解析肿瘤免疫微环境

RNA 告诉我们细胞在想什么,蛋白则揭示细胞在做什么。WTX与空间蛋白共检方案的结合,使研究者得以在同一空间坐标下观察基因调控与功能实现的全过程,真正实现从转录到功能的空间整合分析。

无论是探索肿瘤免疫逃逸机制;描绘组织发育与疾病进展的动态轨迹;还是构建多模态空间图谱,WTX+蛋白共检方案都能为研究者提供精准、直观、全景化的分子影像视角。

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通过将蛋白检测与亚细胞分辨率下的RNA表达相结合,直接在组织中确认候选生物标志物

 

例如在肿瘤免疫研究中,WTX+蛋白共检能清晰回答以下关键问题:

● 肿瘤免疫逃逸过程中,PD-L1 的高表达是否伴随转录活性上调?

● T细胞在空间位置上呈现何种激活或耗竭谱系?

● 免疫检查点分子与细胞信号通路是否在特定微区协同活跃?

 

这些问题,以往需要多轮实验与复杂数据配准,而在本方案中,只需一张切片、一次检测,即可在单细胞层面完整解析。

 

 

未来已来,空间组学的新标配

WTX不仅是一个全转录组检测 panel,更是一套可拓展的多组学整合框架。通过与蛋白组学的深度融合,研究者得以在单细胞层面同步捕获表达-功能的双维度信息,让每一个细胞的故事都被完整记录。

从单一维度的信号捕捉,到多模态的空间整合,从静态的组织切片,到动态的生命图谱,SMI WTX +蛋白共检,让空间组学真正进入立体时代。

 

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如果你希望了解更多 WTX 联合检测方案(如WTX+PCF、WTX+DSP、WTX+LCM等),敬请持续关注后续推文,我们将逐一揭晓每种组合的技术亮点与应用价值。想要更深入了解或定制化方案?识别下方二维码或点击“阅读原文”,欢迎与我们联系,一起探索空间多组学的更多可能!

 

 

 

 

 

 

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