WTX领航多组学融合！单细胞空间全转录组+空间多蛋白检测——绘制生命动态图谱的超级工具包
年度旗舰级单细胞空间组学平台CosMx SMI- Whole Transcriptome Panel（WTX） 不止于单细胞空间转录组学的突破，更以全转录组覆盖（18000+基因）的无偏检测能力，重新定义生命动态图谱研究的维度。但这还不够，我们还想要空间蛋白维度的检测，全景观观测生命过程、组织微环境。
当传统技术困于局部信号捕捉，WTX已实现从单细胞分辨率到全转录组的无缝覆盖，让组织微环境中每个细胞的表达密码都清晰可辨。但我们深知：生命是复杂的，所以我们渴望更全景的视角：将空间蛋白维度深度融合，实现对生命进程与组织微环境的多模态、全尺度观测。
为实现这一目标，我们以“技术宅”式的极致严谨，将多元技术模块视作待选的“食材”：不满足于简单堆砌，而是历经深度适配，沉淀出开箱即用的“全栈式解决方案”——让前沿的空间转录组与空间蛋白检测技术，真正成为您探索生命图谱的趁手利器。
1. WTX +蛋白panel同片检测
CosMx SMI平台独有的优势在于，能够在同一张组织切片上同时完成全转录组与多重蛋白的共检测，实现真正的单细胞分辨率空间多组学同步识别。当前的SMI Protein Panel覆盖64种关键蛋白，包含免疫检查点分子（如PD-1、PD-L1、CTLA4）、T细胞活化标志物（CD69、CD25等）以及信号转导分子（pSTAT1、pAKT）等，为免疫治疗机制研究与免疫微环境表型刻画提供强有力支持。
主要优势：
1、单片共检测：只需一张切片检测，RNA与蛋白信号来源一致，避免跨切片配准误差。
2、功能分子覆盖精准：以免疫相关分子为核心，特别适用于T细胞活化状态、免疫逃逸机制、肿瘤-免疫界面研究。
3、数据关联自然：同一空间区域，同一细胞，可直接关联转录表达与蛋白丰度变化，开展信号通路活性评估与细胞状态分类。
2. WTX +PCF
PCF(PhenoCycler-Fusion)利用多轮次成像，突破传统荧光成像通道限制，支持100种以上蛋白标志物同时检测，并可以实现单细胞分辨率的空间蛋白组谱绘制。IO60 panel是即用型一款肿瘤及免疫多重抗体组合，涵盖60个经验证的人源FFPE样本标志物，可在一次实验中全面解析肿瘤细胞、基质细胞及免疫微环境结构，为多癌种的肿瘤微环境构成与空间异质性解析提供高效标准化方案。通过将SMI WTX的转录信息与IO60的蛋白图谱相结合，研究者能够从两个维度重构肿瘤及其微环境的全景观空间图谱。
主要优势：
1、空间分辨率匹配：IO60可实现与SMI相同的亚细胞级空间分辨率，确保RNA-Protein层面数据精准对齐。
2、IO60 panel将肿瘤标记物覆盖全面，细胞类型解析深入：涵盖肿瘤细胞（PanCK、SOX2、TP63、角蛋白家族）、基质细胞（Podoplanin、Caveolin、Collagen IV、E-cadherin）、髓系细胞（CD206、CD209、MPO）及NK细胞（CD57、CD107）等多种特异性标记，能够系统刻画肿瘤、免疫与基质间的复杂关系。
3、高度灵活定制：在IO60 panel基础上可根据研究目的灵活增加定制蛋白靶标，兼顾标准化与创新性。
3. WTX +DPA（GeoMx DSP）
GeoMx DSP最新的DPA（Discovery Proteome Atlas）panel可在单次实验中同时检测超过1200种蛋白。这是目前基于抗体的通量最高的商业化空间蛋白检测平台。DPA是专为支持生物标志物发现而设计的检测方案，涵盖多种组织类型、机制通路及研究领域，包括癌症、免疫学和神经生物学：
● 兼容40+种人类组织
● 涵盖120+种生物学过程
● 包含29类功能注释（细胞凋亡、分化、DNA损伤修复、MAPK Signaling、mTOR Signaling、PI3K-Akt Signaling等）
● 当DPA与WTX技术结合时，可在转录组与蛋白组两个层面实现“全局+局域”相结合的空间整合分析。
主要优势：
1、极高通量：实现从免疫、信号转导、代谢到细胞骨架等多维蛋白网络的全面覆盖。
2、灵活的ROI选择：GeoMX DSP具备精细的区域划分与定向检测能力，可针对特定细胞类型或病理区域进行深度蛋白分析
3、互补信息融合：SMI WTX提供精确的空间细胞分型，DPA补充大规模蛋白表达特征，实现“定域-定性-定量”三重融合。
4. WTX+深度蛋白组（LCM）
通过LCM（Laser Capture Microdissection）激光显微切割技术，可在组织水平上精准切割感兴趣的区域，并结合质谱实现全蛋白组无偏检测。当与WTX组合时，可先通过转录组信息识别关键功能区域，再由LCM-MS完成深度蛋白挖掘，不受任何抗体限制。
主要优势：
1、精准切割、区域特异：依据组织形态或SMI识别的功能区域进行精确定义与切割，确保空间信息精准可控。
2、无偏全蛋白组覆盖：无需预设抗体panel，可检测所有表达蛋白，发现未知分子机制。
3、机制验证利器：SMI转录组信息引导感兴趣区域定位，LCM-MS实现蛋白深度挖掘，形成空间机制研究的闭环路。
从转录到功能的空间整合之路
WTX与多平台蛋白组检测技术的有机结合，我们实现了从转录到蛋白、从定位到功能、从单细胞到微环境的全面空间解析。无论是关注肿瘤异质性、免疫治疗应答，还是探索组织发育与疾病进展的动态机制，这些组合方案都能为您提供高分辨率、多维度、可拓展的空间组学整合框架，让空间生物学的研究更具系统性与深度。
如果现有方案还是不过瘾，那一定要和我们联系，一起来定制化。
