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芯空一号Update | 国内首批CosMx SMI WTX实测数据新鲜出炉

 

在空间组学领域,CosMx SMI(Spatial Molecular Imager)平台以其超高分辨率和强大通量受到广泛关注。该平台能够在组织原位水平,实现对单细胞水平RNA的多重、高灵敏度检测,为研究者提供解析组织微环境和细胞间相互作用的强有力工具。

 

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仪器运行过程中

 

Human Whole Transcriptome Panel(WTX)是SMI平台上最高通量的转录组检测解决方案,覆盖约18,000个人类基因,实现对组织全转录组编码基因的原位检测。借助WTX,科研人员不仅可以获得全面的基因表达图谱,还能解析复杂组织中细胞类型、功能状态以及微环境之间的精细互动,为疾病研究和机制探索提供坚实的数据支撑。

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相比于靶向Panel,WTX的优势在于无偏探索,它能够让研究者在不预设基因集合的前提下,全面扫描组织中的分子特征,从而更容易捕捉到新型细胞亚群、未知通路以及潜在的生物标志物。这使得WTX在肿瘤免疫、神经系统疾病、发育生物学及精准医学等领域都展现出广阔应用前景。

 

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WTX实验上机准备过程

 

 

最新进展

让我们一起领略亚细胞分辨率视角下,全转录组编码基因的空间表达分布全貌。

 

统计数据显示,检测组织样本在WTX和6K panel下对比,每个细胞平均转录本和基因检测数提升超过50%(仅为同类型组织统计数据)。

 

CITC中心实验室凭借过硬的专业技术实力和丰富的CosMx SMI 6K panel实验经验,针对WTX全转录组服务,已构建覆盖样本处理至数据分析的全流程闭环体系,各环节衔接紧密无断点,同时具备多类型样本的高度适配能力。这不仅展示了我们在空间组学领域的技术积累和执行力,更意味着实验室能够为合作伙伴和科研客户提供更高维度、更全面、更精准的空间分子信息。

 

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WTX数据进行细胞分割过程中

 

未来,我们期待借助SMI平台的单细胞空间全转录组检测能力,携手推动对疾病发生发展机制的深入剖析,探索组织微环境的空间异质性,乃至为临床转化研究提供坚实的分子依据。

 

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