圆满落幕 - 探索无限可能—2024空间多维组学创新转化研讨会
2024年4月12日,由上海生物芯片有限公司(生物芯片上海国家工程研究中心)、上海市生物化学与分子生物学学会主办,NanoString Technologies、因美纳、上海达迈生物科技有限公司以及布鲁克(北京)科技有限公司协办的“2024空间多维组学创新转化研讨会”圆满落幕。
本次研讨会汇集国内外空间多维组学领域的顶尖专家学者,共同探讨空间多维组学技术的最新研究应用和进展,以及未来发展趋势,为推动精准医疗和药物开发等领域取得创新转化和产业化发展提供了重要的交流平台。
会议伊始,由公司常务副总经理、中心专职副主任韩峻松博士致欢迎词。韩总表示21世纪是生命科学的世纪,生命科学技术更迭也是日新月异,公司自2001年成立以来,紧跟前沿热点,搭建世界前沿技术平台不断发展进步,从基因芯片技术到单细胞测序技术,再到空间组学技术。举办本次会议旨在探讨空间转录组、蛋白组和代谢组等新技术的应用场景和成果,鼓励专家学者分享经验并互动交流,促进行业及产业发展。期待与会者能有所收获,并感谢与会者及协办单位的大力支持。
上海生物芯片有限公司常务副总经理、生物芯片上海国家工程研究中心专职副主任,韩峻松博士
本次研讨会上,多位嘉宾分享了他们在空间多维组学领域的最新研究成果及应用经验。
中国科学院上海药物研究所,教授级高级工程师,刘佳老师的报告题为《应用时空多组学融合技术探索重要疾病的作用机制》。报告介绍了空间代谢组学技术体系的构建、多模态检测流程建立与优化及应用等最新的研究成果。应用这一方法,我们能够很大程度的提高高空间分辨率下的代谢物检测效率,在细胞培养体系、类器官和组织上均实现了单细胞水平的分析。
中国科学院上海药物研究所,教授级高级工程师,刘佳
复旦大学,钱斌治教授的报告题为《单细胞和空间组学的标准化研究》。报告分享了如何采用系统化的方法,整合目前已有的技术和方法,通过统一的标准物质,建立标准化的研究框架,使生物医学领域可以更好地分析和理解单细胞空间组学数据,从而推动单细胞空间组学领域的进步。
复旦大学,教授,钱斌治
东华大学,青年研究员,左春满老师的报告题为《Decoding tumor microenvironments from spatially resolved transcriptomics data through AI models》。报告介绍了系列人工智能方法,使我们能够深入理解肿瘤微环境的空间异质性,并预测与癌症相关的临床表型。这些技术有助于癌症的精准诊断和个性化治疗,为医学研究和临床实践提供了新的突破。
东华大学,青年研究员,左春满
南京医科大学公共卫生学院,杜牧龙副教授的报告题为《早发前列腺癌的遗传和时空异质性研究》。研究通过遗传基因组、单细胞和空间转录组分析揭示了早发前列腺癌(EOPC)的遗传结构和肿瘤微环境异质性,发现EOPC具有高遗传度和雄激素通路活性,巨噬细胞浸润和免疫抑制现象,为精准治疗提供了新思路。
南京医科大学公共卫生学院,副教授,杜牧龙
上海交通大学,丁显廷教授的报告题为《单细胞蛋白组/空间蛋白组技术及应用》。研究强调了在复杂疾病如肿瘤中,多组学靶点异常的重要性,并指出了在有限样本中监测这些变化的挑战。提出多靶点药物治疗能够通过影响疾病网络的多个环节,提高疗效并减少耐药性。研究团队正致力于开发能够同时检测多个组学信息的技术,以优化药物组合和治疗策略。
上海交通大学,教授,丁显廷
中国科学院广州生物医药与健康研究院,研究员,彭广敦老师的报告题目为《Spatial architecture of tissue organization in development and disease》。介绍了通过开发新的空间组学技术及数据整合算法,构建空间位置基因参考坐标系,实现单细胞分辨率的空间位置还原,促进对发育生物学细胞谱系决定、疾病损伤修复以及原位细胞功能特性的认识。
中国科学院广州生物医药与健康研究院,研究员,彭广敦
因美纳售前技术专家李鑫博士的报告题为《因美纳技术助力多组学应用研究》。报告介绍了Illumina新一代测序(NGS)平台能够帮助研究人员实现以一种平台进行多组学研究,并带来了丰富的案例分析。
因美纳售前技术专家,李鑫博士
上海交通大学医学院附属仁济医院,研究员,庄光磊老师的报告题为《基于单细胞技术的肿瘤免疫治疗研究》。研究通过单细胞测序揭示了肿瘤经免疫检查点抑制剂治疗后B细胞和滤泡辅助性T细胞增多,指示三级淋巴结构新生,可作为治疗响应的指标。同时,TNF信号通路与免疫相关副作用(irAE)相关,血浆TNF水平对预测irAE有潜在价值。
上海交通大学医学院附属仁济医院,研究员,庄光磊
复旦大学,研究员,乔亮老师的报告题为《DIA宏蛋白质组技术及其在菌群研究中的应用》。研究团队开发了一种新的数据非依赖采集(DIA)方法,用于精准分析微生物蛋白表达和代谢变化,这对于理解微生物在人体健康中的作用至关重要。通过比较不同蛋白定量策略,建立了高效的微生物宏蛋白质组分析方法,并成功应用于多种疾病肠道菌群的研究,为微生物组学研究提供了强有力的技术支持。
复旦大学,研究员,乔亮
海军军医大学杨富教授的报告题为《RNA m6A修饰参与的肝脏炎癌微环境构建》。研究揭示了m6A甲基转移酶METTL14在代谢性脂肪性肝病(MAFLD)进展中的关键作用。METTL14在患者和模型中的表达降低与脂质积累和肝损伤加剧相关。发现METTL14通过m6A-YTHDF1途径调节GLS2,影响氧化应激和巨噬细胞招募,进而促进肝纤维化。恢复METTL14或GLS2表达,或阻断相关信号通路可改善病情,为MAFLD治疗提供了新策略。
海军军医大学,教授,杨富
南通大学,副研究员,周松林老师的报告题为《脊髓胶质疤痕形成的分子表达时空动力学和细胞间相互作用》。研究通过10x Visium技术研究小鼠脊髓T10半切后的疤痕形成,揭示了疤痕微环境的基因表达梯度和细胞多样性。研究发现成纤维细胞在疤痕中心富集并高表达CD36,使用CD36抑制剂能有效抑制疤痕。研究还提出了疤痕形成的四个阶段,为理解疤痕结构和治疗提供了新见解。
南通大学,副研究员,周松林
复旦大学附属中山医院,研究员,郝洁的报告题为《深度学习驱动的单细胞技术在精准诊疗中的应用》。报告介绍了创新的scSTAR算法,通过统计学模型构建真实-虚拟细胞对解决细胞样本配对问题。团队首次提出了单个细胞动态转录组的概念,并通过多个生物学和临床场景系统性显示了动态特征的价值。
复旦大学附属中山医院,研究员,郝洁
复旦大学生物医学研究院,青年副研究员,王卓的报告题为《单细胞DNA测序用于体液中单细胞良恶性的鉴定》。液体活检虽能检测肿瘤细胞但不足以确诊。研究通过单细胞DNA测序和分子算法,无需原位组织即可判断体液中单细胞的良恶性,推进了“检测+鉴定”的诊断模式,实现了泛癌种患者体液中肿瘤细胞的良恶性鉴定。
复旦大学生物医学研究院,青年副研究员,王卓
上海生物芯片有限公司(生物芯片上海国家工程研究中心),产品经理,蒋敏老师的报告题为《新一代空间组学与生物标志物研究》。空间组学技术的快速进步为我们提供了从多角度深入研究组织结构的能力,这不仅为揭示疾病的发展机制提供了新的洞见,也为发现与疾病诊断、治疗及预后相关的生物标志物提供了创新方法。
上海生物芯片有限公司(生物芯片上海国家工程研究中心),产品经理,蒋敏
来自LifeStrands Genomics 的Ufuk Degirmenci带来了题为《Optimizing CosMx Runs: Best Practices and Insights for Success》的报告。报告介绍了如何优化CosMx技术应用,分享实践经验和解决方案,强调个性化调整流程的重要性,助力用户有效整合技术,提升工作效率和成果。
LifeStrands Genomics,Head of spatial genomics department,Ufuk Degirmenci
布鲁克(北京)科技有限公司,蛋白质组学应用主管,杜潇贤老师的报告题为《超高灵敏度4D-质谱引领空间蛋白质组学研究》。质谱技术在疾病研究和临床应用中扮演关键角色,空间蛋白质组学技术通过揭示蛋白质的空间分布和相互作用,为研究提供新视角。报告介绍了4D-质谱技术的进步、高通量微量样本分析方案,以及该技术在空间蛋白质组学中的应用和进展。
布鲁克(北京)科技有限公司,蛋白质组学应用主管,杜潇贤
NanoString中国区市场经理牛璐瑶的报告题为《多维度空间多组学技术助力科研发现和转化医学应用》。报告介绍了NanoString最新的系列技术研发成果,并带来了详细的案例分析,通过多组学技术助力科研发现和转化医学应用。
NanoString中国市场部经理,牛璐瑶
SBC × 御领生物
空间多组学创新转化研究中心正式揭牌
(右)上海生物芯片有限公司常务副总经理、生物芯片上海国家工程研究中心专职副主任,韩峻松博士;(左)上海御领生物科技有限公司总经理,于公尔
会议同期,上海生物芯片有限公司(生物芯片上海国家工程研究中心)与上海御领生物科技有限公司联合成立的“空间多组学创新转化研究中心”正式揭牌。近年来,空间多组学技术因其在生命科学研究中的巨大潜力而成为全球关注的焦点,相关领域的学术文章发表数量呈现出爆炸性增长。在这一背景下,该研究中心的成立不仅是双方在科研服务领域的一项创新举措,更是在精准医疗时代对空间多组学领域的深入挖掘和持续创新的体现。
双方将致力于推动空间多组学技术的创新应用,加速科研成果向实际应用的转化,共同打造高水平的空间多组学研究与创新转化平台。期待该研究中心在未来助力更多研究和开发取得突破性创新转化成果,为推动整个生命科学领域的发展做出重要贡献。
本次研讨会的成功举办,不仅为空间多维组学领域的科研人员提供了交流合作的平台,探索无限可能,交叉领域的思维碰撞也为提供了更多创新转化的想象空间。随着空间多维组学技术的不断升级和完善,标准化的建立以及新算法的开发,持续为创新转化研究输出新的动力,未来将在生物医药领域发挥更加重要的作用,为人类健康事业作出更大的贡献。
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