芯空一号快讯 | 单细胞联合空间转录组揭示帕金森病黑质的区域性细胞易损特征(IF 81.2)

本研究结合单核RNA测序与Visium空间转录组技术，构建了帕金森进展过程中人类中脑黑质的空间分辨细胞图谱，揭示了多巴胺能神经元的亚群选择性易损、胶质细胞状态变化及血管相关区域重塑等特征。

芯空一号快讯 | Visium HD空间转录组联合PCF空间蛋白组，揭示结直肠癌微转移灶免疫逃逸与复发风险

这项研究展示了空间多组学在肿瘤微转移研究中的重要价值。Visium空间转录组用于发现组织尺度的分子变化，Visium HD进一步定位微小病灶及特定细胞状态，PCF IO60则从蛋白层面验证关键细胞群体、空间邻域及免疫功能表型。不同技术在分子信息、空间分辨率和功能表型上的互补，使研究能够更全面地解析肿瘤细胞与微环境之间的复杂关系。

芯空一号快讯｜空间转录组揭示颌骨骨膜新亚群：巨噬细胞SPP1如何抑制骨再生？

本研究通过单细胞RNA测序与Visium空间转录组相结合，鉴定了具有成骨潜能的Ctsk⁺Fmod⁺骨膜细胞，并揭示骨替代材料周围巨噬细胞与骨膜细胞共同构成的局部微环境。研究进一步通过共培养、SPP1干预及动物实验，支持巨噬细胞来源的SPP1会削弱目标骨膜细胞的成骨能力，而阻断相关信号可在实验模型中部分改善这一效应。

芯空一号快讯 | 跟SBC一起做科研：CosMx空间转录组拆解肾移植慢性排斥

领域里长期并存的四种机制假说，在这项工作里第一次在同一张组织切片上各自拿到了原位证据；而 IL-33 这条轴，也成了临床上已有药物可用的干预靶点。文章里另外还有关于足细胞和系膜细胞的结果，和主线方向一致。按论文自己的说法，这项工作为后续研究指明了可以推进的分子靶点，也为治疗开发提供了新的框架；慢性排斥从讲得清走向管得住，也许正是从这一张切片起步的。

芯空一号update | 从空间异质性到连续功能梯度：空间转录组×空间蛋白HD解析肿瘤微环境

当空间研究从离散区域比较进一步走向连续功能变化，多组学不仅能够更完整地解析肿瘤微环境的形成与演变，也有望进一步识别与疾病进展、治疗响应相关的关键空间功能节点，为生物标志物筛选及后续临床转化提供新的研究依据。

最新CellPhoneDB（v5）用法有变化