双细胞(doublets):是指在单细胞微流控等流程中某个液滴中含有2个及以上的细胞,而在同一个液滴中的细胞在后续分析中带有相同的Cell Barcode,在分析中它们依旧会被当成同一个细胞的数据来处理
从空间多组学角度来看,这项研究的一个亮点在于CosMx SMI空间转录组与GeoMx DSP空间蛋白组的互补应用,以及多重免疫荧光的原位验证。
Cell2Fate是一种基于更现实的生物物理转录动力学模型的全贝叶斯RNA速度模型。cell2fate通过线性化常微分方程(ODE)与贝叶斯建模,将RNA速度解决方案分解为模块,显著提升了RNA速度分析的精度与可解释性,并首次实现了时间动态与空间组织的整合。
本研究通过整合单细胞转录组与10x Visium空间转录组技术,发现了肺腺癌中的一类新型免疫调节型CAF,并进一步将其与肿瘤免疫抑制微环境联系起来。